Para preguntar por qué en japonés, puedes usar tanto なぜ como どうして, pues ambas significan "por qué" y son básicamente intercambiables. Una tercera forma de decir "por qué" es なんで que es usado de la misma forma que los otros dos, pero es más casual.
Ejemplos
なぜ日本語を勉強していますか？
¿Por qué estás aprendiendo japonés?
[por qué | japonés | estudiando?]
どうして、そんなに歴史に詳しいですか？
¿Cómo es que sabes tanto de historia?
[por qué | hasta tal punto | historia | detallado/bien informado]
¿Te gustaría saber cómo contestar preguntas como estas, o dar razones para explicar algo? Haz clic aquí para leer sobre から, だから y なぜなら.